Sedangkan Komisaris Perseroan Yusmada Faizal diberhentikan setelah menjabat sejak 24 Agustus 2016.
Muhammad Syaugi memiliki pengalaman sebagai Direktur Jenderal Perencanaan Pertahanan Kementerian Pertahanan RI periode 2014-2017 dan pernah menjabat Kepala Badan SAR Nasional periode tahun 2017 – 2019.
Sedangkan Adnan Pandu Praja sebelumnya pernah menjabat sebagai Wakil Pimpinan Komisi Pemberantasan Korupsi (KPK) periode 2011 – 2015 dan merupakan anggota TC 309 ISO 37001 Sistem Management Anti Penyuapan pada tahun 2017.
Dengan dilakukan pengangkatan tersebut, maka susunan pengurus perseroan menjadi sebagai berikut:
Dewan Komisaris
Komisaris Utama : Muhammad Syaugi
Komisaris : Rukijo
Komisaris : Adnan Pandu Praja
Komisaris : Muhtasor
Komisaris : Zulfikri (ex Officio Direktur Jenderal Perkeretaapian Kementerian Perhubungan RI);
Direktur Utama : William P. Sabandar
Direktur Konstruksi : Silvia Halim
Direktur Operasi & Pemeliharaan : Muhammad Effendi
Direktur Keuangan & Administrasi : Tuhiyat
Direktur Pengembangan & Dukungan Bisnis : Ghamal Peris
